По итогам первого круга ФОНБЕТ-первенства России по футболу определились участники шестого Кубка Футбольной Национальной Лиги, который пройдет с 11 по 24 февраля 2017 года на Кипре.
Право сыграть в данном турнире получают первые 16 команд по итогам первого круга первенства. В нынешнем сезоне ими стали «Динамо-Москва», «Тосно» (1 участие в предыдущие годы), «Факел» (2), «Енисей» (2), «Шинник» (4), «СКА-Хабаровск» (4), «Спартак-2» (1), «Зенит-2» (1), «Тамбов», «Тюмень» (2), «Луч-Энергия» (2), «Кубань», «Химки», «МОРДОВИЯ» (2), «Волгарь» (2), «Спартак-Нальчик» (1).
Кубок ФНЛ - ежегодный товарищеский турнир лучших команд по итогам первого круга первенства ФНЛ.